الفطريات قادرة على إنتاج إنزيمات قوية تعمل على تفتيت المواد الملوثة العضوية مثل النفط ومبيدات الحشرات، والمواد الصناعية المعقدة مثل المذيبات. بعض أنواع الفطريات تنتج إنزيمات مثل الليغنين والبيروكسيديز، التي تحلل المركبات الكيميائية المعقدة إلى مواد أقل ضرراً.
التسميد والتخلص من النفايات
الفطريات تلعب دوراً مهماً في التسميد البيولوجي، حيث تساعد على تحلل النفايات العضوية مثل المخلفات الزراعية والصناعية وتحويلها إلى مواد مفيدة مثل السماد العضوي. تُستخدم بعض أنواعها في المعالجة البيئية للنفايات الغذائية والصناعية، حيث تسهم في تسريع عملية التحلل.
إزالة الملوثات الثقيلة
بعض أنواع الفطريات مثل فطر عيش الغراب (الميتريزيوم) يمكنها امتصاص عناصر ثقيلة من البيئة، مثل الرصاص، الزئبق، الكادميوم، وتحويلها إلى مركبات أقل ضرراً أو احتجازها في الأنسجة الفطرية.
تعديل التربة
الفطريات تُستخدم أيضاً في المعالجة البيئية للتربة الملوثة بالمواد الكيميائية السامة مثل الهيدروكربونات والمواد البلاستيكية. بعض أنواع الفطريات يمكنها تحسين بنية التربة عن طريق زيادة قدرتها على الاحتفاظ بالماء والمواد الغذائية.
عضويتي 
طريقة استخدام الفطريات في المعالجة الحيوية
العرض العادي
